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Bio-du
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11 Messaggi

Inserito il - 07 settembre 2012 : 13:56:56

Ciao a tutti!sto studiando bioninformatica,in particolare la costruzione di alberi filogenetici.
Mi sono imbattuta in questo quesito:
Quali sequenze utilizzate per costruire un albero filogenetico?
a) genomiche, se disponibili
b) EST
c) proteiche
Io penso che la risposta esatta sia la a per� non ne sono sicura in quanto l'utilizzo di sequenze genomiche � comunque soggetto a limiti come per esempio il fatto che geni diversi possono seguire differenti storie evolutive nello stesso gruppo di specie.Qualcuno sa aiutarmi?
grazie

Nereus
Nuovo Arrivato

20 Messaggi

Inserito il - 11 settembre 2012 : 17:56:55

LA risposta penso sia sequenze genomiche perch�:
Proteiche no in quanto le mutazioni sono a carico di nucleotidi e non di AA quindi potrebbero esserci sostituzioni silenti che falsano molto i calcoli delle distanze genetiche (numero di sostituzione/lunghezza totale sequenza).
Le sequenze EST : "An expressed sequence tag or EST is a short sub-sequence of a cDNA sequence.[1] They may be used to identify gene transcripts, and are instrumental in gene discovery and gene sequence determination." sono sequenze di cDNA brevi e imprecise facili da costruire e usate per trovare trascritti in una banca dati.

L'unica che rimane � sequenze genomiche =)

P.S.
Hai come prof Fasano? xD