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Zanna
Nuovo Arrivato
Prov.: Lecco
33 Messaggi |
 Inserito il - 19 gennaio 2007 : 14:49:12
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ciao,
sto usando BLAST in locale. E' molto veloce e mi trovo bene, ma nel pacchetto la documentazione è scarsissima. In rete non ho trovato molto di più. Possibile? 
Qualcuno mi sa consigliare una buona risorsa?
Grazie!
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dallolio_gm
Moderatore
Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna
2445 Messaggi |
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Zanna
Nuovo Arrivato
Prov.: Lecco
33 Messaggi |
 Inserito il - 25 gennaio 2007 : 17:19:09
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grazie dallo,
ne approfitto per chiederti un'altra cosa.
Sto allineando 2-8 geni per volta su un contig che va da 2 a 10 Kbasi.
dato che i vari geni trovano il loro match in posizioni differenti del contig non posso usare un programma di allineamento multiplo, cosa mi consiglieresti di usare? Glimmer fa questo genere di operazione?
grazie! |
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Zanna
Nuovo Arrivato
Prov.: Lecco
33 Messaggi |
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dallolio_gm
Moderatore
Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna
2445 Messaggi |
Inserito il - 05 marzo 2007 : 18:03:19
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| mmm hai provato con la documentazione in /usr/share/docs/blast2? |
Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-) |
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Zanna
Nuovo Arrivato
Prov.: Lecco
33 Messaggi |
Inserito il - 06 marzo 2007 : 12:34:14
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si dallo,
è la stessa che trovi in 'directory_installazione'/blast/blast/doc
a mio avviso è molto stringata.. |
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BLAST LOCALE: documentazione
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), puoi cercare su connotea: 
