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Bian Que
Nuovo Arrivato

99 Messaggi

Inserito il - 20 settembre 2012 : 10:13:08

Salve ragazzi,
in una esercitazione mi si chiedeva il seguente quesito
Riportare le regioni dei promotori di 1000 basi al 3' dei geni DE. Ho scaricato la lista geni DE che ora ho su un file di testo. Come faccio a riportare le regioni dei promotori di questi geni ? uso DAVID o qualche altro sito tipo ENSEMBL ?...potete farmi vedere passo passo cosa fare ? grazie mille per la vostra attenzione

kORdA
Utente Attivo

Prov.: Milano
Città: Monza

1303 Messaggi

Inserito il - 20 settembre 2012 : 12:08:33

David non so se è adatto allo scopo. Ti consiglierei di usare un GenomeBrowser (UCSC http://genome.ucsc.edu/ o Ensembl http://www.ensembl.org/index.html). Da qui puoi vedere inizialmente dove mappano i tuoi geni, poi puoi sbizzarrirti ad aggiungere track per individuare le regioni regolatorie (gli help sono fatti abbastanza bene su come usare questi tools)

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada

Bian Que
Nuovo Arrivato

99 Messaggi

Inserito il - 20 settembre 2012 : 19:46:10

la lista geni in ensembl dove la copio ?