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Autore

Discussione

nettola
Nuovo Arrivato

Città: lecce

26 Messaggi

Inserito il - 19 febbraio 2013 : 10:54:02

ciao a tutti mi potreste spiegare passo passo come funziona questo programma?
Arrivo alla pagina http://emboss.bioinformatics.nl/cgi-bin/emboss/pestfind ; inserisco la mia sequenza FASTA ma mi da errore e non riesco a ottenere i risultati. La proteina è la seguente: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/YP_002993838.1

Grazie in anticipo

nettola

kORdA
Utente Attivo

Prov.: Milano
Città: Monza

1303 Messaggi

Inserito il - 19 febbraio 2013 : 11:12:49

che genere di errore? A me esce uno del tipo:

Citazione:
Error application terminated
pestfind: /geninf/prog/lib/libgcc_s.so.1: version `GCC_4.2.0' not found (required by /usr/lib/libstdc++.so.6)
pestfind: /geninf/prog/lib/libgcc_s.so.1: version `GCC_3.3' not found (required by /usr/lib/libstdc++.so.6)

Se così fosse anche per te direi che sei nelle pesti, per usare un gioco di parole

.
In pratica presso il server, credo, mancano i compilatori C. Cosa molto strana, ma la responsabilità è di chi mantiene questo servizio e c'è ben poco da fare.

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada

nettola
Nuovo Arrivato

Città: lecce

26 Messaggi

Inserito il - 19 febbraio 2013 : 11:21:52

si infatti è questo il tipo di errore! grazie pensavo di essere io l'incapace!

nettola

kORdA
Utente Attivo

Prov.: Milano
Città: Monza

1303 Messaggi

Inserito il - 19 febbraio 2013 : 12:00:37

Citazione:
Messaggio inserito da kORdA
In pratica presso il server, credo[...]

Però non ne sono sicuro al 100%, spero che qualcuno che usa Emboss quotidianamente ti sappia rispondere con maggiori dettagli.
Se proprio devi usare questo tool ti consiglio di installare una versione locale di Emboss ma, per quanto ne so io, vedi sopra...