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Valmira
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 Inserito il - 16 dicembre 2014 : 13:12:11
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Salve a tutti,
devo allineare una sequenza proteica con tutte quelle di proteine simili nel database di strutture risolte nella pdb, per sapere di quanto la sequenza della mia proteina differisce da quelle a struttura già nota.
Ho provato a fare un multiallineamento con ClustalW, ma quello che il programma fa, dato un elenco di sequenze, è allinearne ciascuna con tutte le altre, invece a me serve, data una sequenza "X" di riferimento da un lato, e un elenco di altre sequenze dall'altro, allineare la sola sequenza "X" con tutte le altre...spero di essere stata chiara...
sapete aiutarmi?
grazie
Valentina
ps. risolto. http://web.expasy.org/blast/
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allineamento multiplo proteine
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