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Crick82
Utente Junior

139 Messaggi

Inserito il - 30 marzo 2007 : 11:12:04

Ciao ragazzi, ho sostenuto l'esame di bioinformatica da un po' e ho gi� dimenticato alcuni dei siti utili per l'analisi bioinformatica di una sequenza nucleotidica ma anche proteica.
Mi potete gentilmente elencare quali sono i siti che permettono:
1) Allineare 2 sequenze nucleotidiche
2) Confrontare la propria sequenza nucleotidica con quelle in banche dati.
3) Cercare l'ORF nella propria sequenza
4) Prevedere il tradotto data la sequenza nucleotidica
5) Allineare 2 sequenze amminoacidiche

Vi ringrazio anticipatamente.

Fil23
Utente Junior

Prov.: estero
Citt�: London

238 Messaggi

Inserito il - 30 marzo 2007 : 11:56:26

Ciao.
1) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/bl2seq/wblast2.cgi
2) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/
3) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html
4) http://expasy.org/tools/dna.html
5) http://www.ch.embnet.org/software/LALIGN_form.html
cao ciao

dallolio_gm
Moderatore

Prov.: Bo!
Citt�: Barcelona/Bologna

2445 Messaggi

Inserito il - 30 marzo 2007 : 23:34:51

ciao,
ho spostato l'altro messaggio in un altro topic (http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=3393), mi sembrava pi� chiaro.

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)

Crick82
Utente Junior

139 Messaggi

Inserito il - 06 aprile 2007 : 18:59:22

Mi potete indicare anche il sito che permette di ottenere la sequenza complementare a quella immessa?
Grazie