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3 Messaggi

Inserito il - 16 settembre 2017 : 11:14:57

Salve a tutti, avrei bisogno di aiuto con il codice di una proteina: 1A0H.
In base al PDB, ho capito che si tratta di un tetramero.
Come faccio a convertire la sequenza FASTA (che � amminoacidica giusto?)in sequenza nucleotidica?
In pi� come faccio a fare una ricerca di similarit� in BLAST sia per la sequenza aa che nt?
Grazie a tutti quelli che interverranno.

domi84
Moderatore

Citt�: Glasgow

1724 Messaggi

Inserito il - 16 settembre 2017 : 19:54:02

FASTA � una sequenza in questo formato:


>NOME
aaabbbcccdddsequenza

Pu� essere amminoacidica o nucleotidica.

Se vai su PDB, c'� la scheda "sequence" e puoi scaricare la fasta.

Poi basta che cerchi su google blast, la inserisci e la cerchi.......

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
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