Forum

Utilità
Cerca nel sito:
Scrivimi Contattaci
Glossario Dizionario
Strumenti per interagire con il sito Tools
Mappa del sito Mappa del sito
I libri
consigliati:

Dove ci porta la scienza
Dove ci porta la scienza
Alberto Oliverio

Ingegneria genetica. Le biotecnologie tra scienza e business
Ingegneria genetica. Le biotecnologie tra scienza e business
Mae W. Ho

Microbiologia
Microbiologia
John Harley, Donald Klein, Lansing Prescott

Altri Libri
Nome Utente:
 Password:
Riconoscimi automaticamente
 Tutti i Forum
 MolecularLab
 Bioinformatica
 TRADUXIONE(IN TERMINI COMPUTAZIONALI)!!!!!!!!!		  Nuova Discussione  Nuovo Sondaggio Nuovo Sondaggio
 Rispondi Aggiungi ai Preferiti Aggiungi ai Preferiti
Cerca nelle discussioni
I seguenti utenti stanno leggendo questo Forum Qui c'č:
Risorse di Bioinformatica: Guide tools online Blog InsideBioinfo Siti di Bioinformatica Protocolli Ultime notizie

Aggiungi Tag Aggiungi i tag

Quanto č utile/interessante questa discussione:

Autore Discussione  

Gio Gio
Nuovo Arrivato




17 Messaggi
Inserito il - 30 agosto 2007 : 14:51:01  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Gio Gio Invia a Gio Gio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
sapete descrivermi qlk esempio o esercixio sulla traduxione di una di una sequenza nucleotidica??graxie

dallolio_gm
Moderatore


Prov.: Bo!
Cittā: Barcelona/Bologna


2445 Messaggi
Inserito il - 05 settembre 2007 : 21:09:32  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dallolio_gm  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di dallolio_gm Invia a dallolio_gm un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Vorrai dire 'traduzione'?
Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)
Torna all'inizio della Pagina

Gio Gio
Nuovo Arrivato




17 Messaggi
Inserito il - 06 settembre 2007 : 09:24:03  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Gio Gio Invia a Gio Gio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
.........................................traduzione
Torna all'inizio della Pagina

dallolio_gm
Moderatore


Prov.: Bo!
Cittā: Barcelona/Bologna


2445 Messaggi
Inserito il - 06 settembre 2007 : 11:15:45  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dallolio_gm  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di dallolio_gm Invia a dallolio_gm un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
beh, č molto semplice:
tu hai una sequenza di DNA (es. AGAGTGTAGGTAGTAGCGCGCGCATGTCGTCACC); conosci il significato del codice genetico (es. che il codone CUU codifica per la leucina), e semplicemente non fai altro che dividere la tua sequenza in triplette e calcolare la proteina corrispondente.

In genere visto che ci sono 6 diversi modi di tradurre una sequenza nucleotidica (partendo dalla 1a, 2a o 3a posizione, e andando nel senso opposto), si usa calcolare la traduzione della stessa per 6 volte.

ciao e benvenuta nel forum.
Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)
Torna all'inizio della Pagina

dallolio_gm
Moderatore


Prov.: Bo!
Cittā: Barcelona/Bologna


2445 Messaggi
Inserito il - 06 settembre 2007 : 13:10:09  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dallolio_gm  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di dallolio_gm Invia a dallolio_gm un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
p.s. esempio di esercizio di traduzione:

Tu hai la seq. nucleotidica seq:
seq = 'agtccggatacgccgatcagtacgaggtcgatcaccggcgcccattgt'

per tradurla, la scomponi in triplette:
-> 'agt', 'ccg', 'gat', 'acg', 'ccg', 'ata', 'ccg', 'gcg', 'ccc', 'att'

prendi la tabella su wikipedia, e ti ricavi la sequenza corrispondente ad ogni tripletta:
'agt' > Serina [S], 'ccg' -> Prolina [P], 'gat' -> Acido Aspartico [D], etc..

Alla fine, ti ricavi la seq. della proteina corrispondente:
proteina = 'SPDTPISTRSITGAHC'

Se il prof te lo richiede, ripeti l'esercizio con gli altri schemi di lettura.

Se vuoi un esempio in biopython:

>>> from Bio.Seq import Seq, translate
>>> seq = Seq('agtccggatacgccgatcagtacgaggtcgatcaccggcgcccattgt')
>>> translate(seq)
'SPDTPISTRSITGAHC'

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)
Torna all'inizio della Pagina

Gio Gio
Nuovo Arrivato




17 Messaggi
Inserito il - 06 settembre 2007 : 13:37:32  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Gio Gio Invia a Gio Gio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
grazie!sei stato molto gentile...purtroppo nn ho potuto seguire alcune lezioni e questo č il risultato...
Torna all'inizio della Pagina
  Discussione  

Quanto č utile/interessante questa discussione:

 Nuova Discussione  Nuovo Sondaggio Nuovo Sondaggio
 Rispondi Aggiungi ai Preferiti Aggiungi ai Preferiti
Cerca nelle discussioni
Vai a:
MolecularLab.it © 2003-18 MolecularLab.it Torna all'inizio della Pagina