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Autore

Discussione

Danyo
Nuovo Arrivato

6 Messaggi

Inserito il - 11 gennaio 2008 : 22:04:11

Qualcuno pu� dirmi qualcosa su gene ontology in particolare per quanto riguarda l'hypergeometric test? Grazie

dallolio_gm
Moderatore

Prov.: Bo!
Citt�: Barcelona/Bologna

2445 Messaggi

Inserito il - 12 gennaio 2008 : 00:45:48

Gene Ontology � un progetto nato per definire una terminologia chiara e universale per descrivere i geni e le loro funzioni.

Per esempio, un termine di GO potrebbe essere 'coinvolto nella trasduzione del segnale': questo significa che tutti i geni etichettati con questo termine sono coinvolti nella trasduzione del segnale e che non esistono sinonimi o altri modi per dire ci�.

Il test che hai indicato � un test statistico, che pu� essere usato per esempio per determinare se all'interno di un set di geni, alcuni termini di GO sono rappresentati con maggiore o minore frequenza di quello che ci si potrebbe aspettare.
Per esempio, io potrei prendere l'insieme di tutti i geni coinvolti in una malattia trasmessa geneticamente e fare un test del genere per determinare se la maggior parte di questi sono coinvolti in un particolare meccanismo cellulare o nello sviluppo di un determinato organo.

- http://geneontology.org/GO.doc.shtml
- http://www.jprogo.de/tools.jsp

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)

gpdimonderose
Nuovo Arrivato

Prov.: Firenze
Citt�: florence

23 Messaggi

Inserito il - 17 gennaio 2008 : 14:36:01

mah esite l'ontologia del gene?...a me pare sia solo un'ontika o un'epistemika....o mi sbaglio?

domi84
Moderatore

Citt�: Glasgow

1724 Messaggi

Inserito il - 17 gennaio 2008 : 15:11:01

Citazione:
Messaggio inserito da gpdimonderose

mah esite l'ontologia del gene?...a me pare sia solo un'ontika o un'epistemika....o mi sbaglio?

gene ontology non ha niente a che vedere con la filosofia...� solo il nome scelto progetto...

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...

gpdimonderose
Nuovo Arrivato

Prov.: Firenze
Citt�: florence

23 Messaggi

Inserito il - 17 gennaio 2008 : 15:17:47

....quindi � solo una epistemika?