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Danyo
Nuovo Arrivato
6 Messaggi |
 Inserito il - 11 gennaio 2008 : 22:04:11
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Qualcuno può dirmi qualcosa su gene ontology in particolare per quanto riguarda l'hypergeometric test? Grazie
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dallolio_gm
Moderatore
Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna
2445 Messaggi |
Inserito il - 12 gennaio 2008 : 00:45:48
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Gene Ontology é un progetto nato per definire una terminologia chiara e universale per descrivere i geni e le loro funzioni.
Per esempio, un termine di GO potrebbe essere 'coinvolto nella trasduzione del segnale': questo significa che tutti i geni etichettati con questo termine sono coinvolti nella trasduzione del segnale e che non esistono sinonimi o altri modi per dire ciò.
Il test che hai indicato é un test statistico, che può essere usato per esempio per determinare se all'interno di un set di geni, alcuni termini di GO sono rappresentati con maggiore o minore frequenza di quello che ci si potrebbe aspettare.
Per esempio, io potrei prendere l'insieme di tutti i geni coinvolti in una malattia trasmessa geneticamente e fare un test del genere per determinare se la maggior parte di questi sono coinvolti in un particolare meccanismo cellulare o nello sviluppo di un determinato organo.
- http://geneontology.org/GO.doc.shtml
- http://www.jprogo.de/tools.jsp |
Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-) |
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gpdimonderose
Nuovo Arrivato
Prov.: Firenze
Città: florence
23 Messaggi |
 Inserito il - 17 gennaio 2008 : 14:36:01
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 mah esite l'ontologia del gene?...a me pare sia solo un'ontika o un'epistemika....o mi sbaglio?  |
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domi84
Moderatore
Città: Glasgow
1724 Messaggi |
Inserito il - 17 gennaio 2008 : 15:11:01
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Citazione:
Messaggio inserito da gpdimonderose
mah esite l'ontologia del gene?...a me pare sia solo un'ontika o un'epistemika....o mi sbaglio?
gene ontology non ha niente a che vedere con la filosofia...è solo il nome scelto progetto... |
Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato... |
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gpdimonderose
Nuovo Arrivato
Prov.: Firenze
Città: florence
23 Messaggi |
Inserito il - 17 gennaio 2008 : 15:17:47
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....quindi è solo una epistemika?  |
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Discussione |
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gene ontology
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