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scamiolo
Nuovo Arrivato
9 Messaggi |
 Inserito il - 29 gennaio 2008 : 15:08:21
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Ciao Ragazzi
avrei una domanda per voi. Vorrei utilizzare i tools disponibili online per valutare l'interazione tra due proteine. Tutti però richiedono il file pdb delle due proteine di cui calcolare l'interazione. In certi casi però il file pdb non è disponibile. C'e' un qualche software che permette di creare un file pdb (con una struttura tridimensionale naturalmente che non rispetti la reale conformazione dellla proteina) partendo solo dalla sequenza? L'ideale sarebbe un software che generi un pdb file da un file multifasta così da poter studiare l'interazione anche tra più di due proteine.
Grazie a tutti per l'aiuto!
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dallolio_gm
Moderatore
Prov.: Bo!
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2445 Messaggi |
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kORdA
Utente Attivo
Prov.: Milano
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1303 Messaggi |
Inserito il - 29 gennaio 2008 : 15:37:16
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Citazione:
Messaggio inserito da dallolio_gm
Leggi qui: http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=2680
...é l'equivalente di una tesina di specialistica di bioinformatica.
...
Chiamala tesina ...io sto facendo a pugni ancora adesso con Modeller
Quello che cerchi tu si chiama fold recognition. Prova a googlare con questo termine, non ti do' nessun link, perche' nessun link offrirebbe un panorama completo, a parer mio, data la vastita' dell'argomento |
http://www.linkedin.com/in/dariocorrada |
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kORdA
Utente Attivo
Prov.: Milano
Città: Monza
1303 Messaggi |
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scamiolo
Nuovo Arrivato
9 Messaggi |
Inserito il - 29 gennaio 2008 : 15:49:02
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Grazie Mille ragazzi. Siete stati molto gentili, utili ed anche molto veloci!
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Creare file PDB
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