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Franceska82
Nuovo Arrivato
Città: Napoli
21 Messaggi |
 Inserito il - 12 febbraio 2008 : 13:18:30
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ciao a tutti,
si sà dell'utilità di procheck per determinare il ramachandran plot di un modello pdb, ma nel comnado bisogna inserirvi la risoluzione.
Ora mi chiedevo, se io costruisco un mio modello sulla base di uno scaricato dalla banca dati, devo mettere quella come risoluzione giusto?
altra domanda: Se io ho effettuato una simulazione di dinamica molecolare e voglio conoscere l'andamento degli angoli psi e phi, cioè tutte le conformazioni assunte da tutti i residui nel corso della simulazione posso farlo con procheck?
Ha senso farlo su un pdb calcolato usando come intervallo tutta la dinamica o ha più senso calcolare la struttura media?
Aspetto consigli...
grazie mille
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