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Autore

Discussione

greace
Nuovo Arrivato

Città: ancona

43 Messaggi

Inserito il - 07 giugno 2008 : 11:35:55

chi mi sa dire che cosa vuol dire la voce QUERY COVERAGE quando si effettua una ricerca in banca dati con BLAST???
grazie a tutti

greace...

dallolio_gm
Moderatore

Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna

2445 Messaggi

Inserito il - 07 giugno 2008 : 12:17:32

La percentuale delle basi appartenenti alla tua sequenza query che sono state incluse nell'allineamento.

Per esempio, se tu hai una sequenza di 10 basi:
ACTGACTGAC

e solo 4 di queste sono incluse nell'allineamento, query coverage é uguale a 0.4.

-> http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Web/Newsltr/V15N2/BLView.html (in fondo)

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)