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Kirian
Nuovo Arrivato
7 Messaggi |
Inserito il - 08 settembre 2008 : 16:15:20
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ciao sono ai miei primi passi con il programma Pymol e voglio utilizzarlo per fare una breve lezione a dei ragazzi delle medie sul DNA. Sto cercando (già pronta) la doppia elica di Dna. per caso qualcuno mi sa dire dove posso scaricarla già fatta? esistono dei data base per chi sta imparando?
grazie mille Fra
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RNA world
Utente Junior
370 Messaggi |
Inserito il - 08 settembre 2008 : 16:55:56
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ciao,
potresti cercare una sequenza su PDB, come questa:
http://www.rcsb.org/pdb/explore.do?structureId=1QC1
e fare un'immagine come questa (si possono fare molte piu cose...)
Immagine:
67,4 KB
se hai bisogno chiedi pure!
ps: immagino sia molto difficile spiegare il DNA a ragazzi delle medie, penso che sui loro libri ci siano degli schemi del DNA molto piu comprensibili... |
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Kirian
Nuovo Arrivato
7 Messaggi |
Inserito il - 09 settembre 2008 : 10:21:54
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GRAZIE!! ora ci provo. è vero, sui libri ci sono un sacco di schemi, ma utilizzare un supporto informatico mi aiuta ad attirare l'attenzione e mi permette di "manipolare" la molecola al momento per sottolineare meglio alcuni dettagli. L'unico grosso problema è che io non sono molto informatizzata e Pymol è veramente difficile!!! Non esiste un tutorial semplice in italiano per imparare ad usarlo? comunque grazie mille!! Fra |
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Kirian
Nuovo Arrivato
7 Messaggi |
Inserito il - 09 settembre 2008 : 10:37:34
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ho provato ma l'estensione non va bene.. come si fa a convertirlo? scusate l'ignoranza
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RNA world
Utente Junior
370 Messaggi |
Inserito il - 09 settembre 2008 : 11:03:48
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ciao, allora per scaricare il file da aprire con pymol devi fare cosi:
Immagine:
49,41 KB
dopo averlo scaricato lo puoi aprire con pymol. Quando lo apri però non ti viene rappresentato come ho messo io nell'immagine, quindi io ti consiglio di fare cosi:
- nascondere tutto ciò che ti viene rappresentato all'inizio:
Immagine:
46,34 KB
- mostrare tutto come "cartoon":
Immagine:
44,71 KB |
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RNA world
Utente Junior
370 Messaggi |
Inserito il - 09 settembre 2008 : 11:06:06
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Penso che questa discussione andrebbe spostata nella sezione di bioinformatica... grazie |
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RNA world
Utente Junior
370 Messaggi |
Inserito il - 10 settembre 2008 : 22:05:23
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ciao,
questo è un esempio di video molto molto semplice che è possibile fare in 10 minuti con pymol.
La qualità non è delle migliori, per diversi motivi:
- uso di pochi frames per la creazione del filmato
- uso di windows movie maker per montare le immagini (frames)
- ho creato un file di soli 100 kb per poterlo caricare velocemente sul forum..
ciao
Allegato: dnaex.zip 91,03 KB |
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Kirian
Nuovo Arrivato
7 Messaggi |
Inserito il - 11 settembre 2008 : 09:24:27
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Grazie mille! ce l'ho fatta!! la prossima domanda/risposta la metto in Bioinformatica Fra |
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