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Roberta2186
Nuovo Arrivato
15 Messaggi |
 Inserito il - 10 giugno 2008 : 15:07:00
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Ciao!Avrei bisogno urgentemente di risolvere questo esercizio per domani!C'è qualcuno che mi può aiutare?Grazie!
Q) Date le seguenti indicazioni prese da una banca dati:
mRNA join(197092..197222,199657..199733,213889..213990,
215186..216022,216121..218031,218100..219116,
219216..>221420)
/gene="ZNF275"
/product="zinc finger protein 275"
/note="Derived by automated computational analysis using
gene prediction method: GNOMON. Supporting evidence
includes similarity to: 3 mRNAs, 82 ESTs"
/transcript_id="XM_001082824.1"
/db_xref="GI:109132684"
/db_xref="GeneID:695012"
Gap 197741..197984
/estimated_length=244
CDS join(199703..199733,213889..213990,215186..216022,
216121..216185)
/gene="ZNF275"
/codon_start=1
/product="zinc finger protein 275"
/protein_id="XP_001082824.1"
/db_xref="GI:109132685"
/db_xref="GeneID:695012"
Si indichi:
Q.1) se si tratta di una sequenza del genoma (?), di mRNA ( ), di una coding sequence( ) , o altro; Perchè?
Q.2) Quanto è lunga, se presente, la regione codificante?
Q.3) Quanti, se presenti, gli introni?
Q.4) Quanto è lunga se descritta la 5’ UTR della sequenza?
Q.5) Quanto è lunga se descritta la 3’ UTR della sequenza?
Grazie!!!
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n/a
deleted
Città: Napoli
10 Messaggi |
Inserito il - 10 giugno 2008 : 21:26:37
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 ciao anche io domani dovrò fare la prov a e neanche io riesco a risolvere quest'esercizio... |
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domi84
Moderatore
Città: Glasgow
1724 Messaggi |
Inserito il - 10 giugno 2008 : 23:26:08
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Q.1) A me sembra un genomico, dove la seq di mRna comincia dal nt 197092
Q.2) La regione codificante (CDS) è si ottiene mettendo vicini i seguenti pezzi:
CDS join(199703..199733,213889..213990,215186..216022,216121..216185)
199703..199733=30 nt
213889..213990=101 nt
215186..216022=836 nt
216121..216185=65 nt
la cui somma è 1032 nt
Q.3)Questi sono gli esoni.
mRNA join(197092..197222,199657..199733,213889..213990,
215186..216022,216121..218031,218100..219116,
219216..>221420)
Gli introni sono fra queste sequenze, quindi sono 6 (praticamente ogni "," indica un introne)
Q.4) La 5' UTR va dall'inizio del mRna all'inizio del CDS, quindi
199703..199733=30 nt
199657 e 199703=46 nt
76 nt
Q.5) La 3' UTR va dall'ultimo nt del CDS all'ultimo del mRna, quindi
216121..218031=1910
218100..219116=1066
219216..221420=2204
il totale è= 5180 nt
(spero di non aver sbagliato niente...)
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Esercizio: trovare caratt. sequenza RNA
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